Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms