Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLHL40Q2TBA0 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLHL40Q2TBA0 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms