Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM187BQ17R55 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms