Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPROQ16827 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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