Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAMA3Q16787 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LAMA3Q16787 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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