Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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