Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FSCN1Q16658 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms