Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
FXNQ16595 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
FXNQ16595 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FXNQ16595 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FXNQ16595 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FXNQ16595 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FXNQ16595 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FXNQ16595 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
FXNQ16595 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
FXNQ16595 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
FXNQ16595 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms