Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
NEDD8Q15843 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NEDD8Q15843 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NEDD8Q15843 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NEDD8Q15843 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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NEDD8Q15843 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NEDD8Q15843 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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