Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ITSN1Q15811 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms