Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ALX1Q15699 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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