Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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TRIP10Q15642 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRIP10Q15642 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TRIP10Q15642 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TRIP10Q15642 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TRIP10Q15642 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TRIP10Q15642 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TRIP10Q15642 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TRIP10Q15642 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TRIP10Q15642 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TRIP10Q15642 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRIP10Q15642 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms