Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TRADDQ15628 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRADDQ15628 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms