Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SIX1Q15475 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms