Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SEC23BQ15437 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms