Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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PTPRRQ15256 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PTPRRQ15256 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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