Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NCAPHQ15003 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
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