Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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NWD1Q149M9 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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NWD1Q149M9 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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NWD1Q149M9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NWD1Q149M9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
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