Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
RAB39AQ14964 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms