Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NFIXQ14938 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
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