Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms