Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LAMC2Q13753 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LAMC2Q13753 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms