Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ALCAMQ13740 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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