Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PMS2P11Q13670 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms