Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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UBE2V1Q13404 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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UBE2V1Q13404 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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UBE2V1Q13404 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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UBE2V1Q13404 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
UBE2V1Q13404 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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