Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP140Q13342 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP140Q13342 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP140Q13342 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP140Q13342 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP140Q13342 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP140Q13342 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SP140Q13342 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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SP140Q13342 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SP140Q13342 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP140Q13342 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP140Q13342 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP140Q13342 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP140Q13342 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP140Q13342 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SP140Q13342 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP140Q13342 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP140Q13342 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SP140Q13342 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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SP140Q13342 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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