Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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CALCOCO2Q13137 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CALCOCO2Q13137 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CALCOCO2Q13137 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CALCOCO2Q13137 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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CALCOCO2Q13137 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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CALCOCO2Q13137 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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CALCOCO2Q13137 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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CALCOCO2Q13137 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CALCOCO2Q13137 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
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