Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CHAF1BQ13112 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CHAF1BQ13112 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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