Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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NFIAQ12857 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NFIAQ12857 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NFIAQ12857 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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