Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC15Q0P6D6 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms