Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
LOXL1Q08397 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms