Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
FOXM1Q08050 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms