Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms