Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTBQ06643 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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LTBQ06643 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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LTBQ06643 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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LTBQ06643 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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LTBQ06643 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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LTBQ06643 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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LTBQ06643 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
LTBQ06643 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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