Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CALD1Q05682 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALD1Q05682 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms