Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIN1Q05586 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GRIN1Q05586 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms