Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP7AQ04656 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms