Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms