Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
E2F1Q01094 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms