Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
IRF9Q00978 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms