Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK16Q00536 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms