Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HTRA4P83105 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms