Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB15P59190 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAB15P59190 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB15P59190 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB15P59190 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms