Protein–RNA interactions for Protein: P53582

METAP1, Methionine aminopeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1P53582 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
METAP1P53582 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
METAP1P53582 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
METAP1P53582 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
METAP1P53582 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
METAP1P53582 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
METAP1P53582 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms