Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERFP50548 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERFP50548 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERFP50548 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms