Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CSRP3P50461 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CSRP3P50461 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms