Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GNPDA1P46926 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms