Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCR1P46094 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCR1P46094 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCR1P46094 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCR1P46094 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCR1P46094 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCR1P46094 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCR1P46094 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCR1P46094 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
XCR1P46094 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
XCR1P46094 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XCR1P46094 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
XCR1P46094 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XCR1P46094 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
XCR1P46094 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
XCR1P46094 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms