Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GGCXP38435 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GGCXP38435 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GGCXP38435 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms