Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms